Senatas yra Universiteto akademinių reikalų valdymo organas. Jis sudaromas 5 metų kadencijai iš 35 narių –rektorius, profesoriai, docentai, mokslininkai, pripažinti menininkai ir studentai. Senatas savo veikloje vadovaujasi Lietuvos Respublikos įstatymais, Klaipėdos universiteto Statutu, Klaipėdos universiteto Senato darbo reglamentu.